L'île est montagneuse. Elle offre sur son côté sud une flore sèche du fait de l'exposition aux vents et aux embruns tandis qu'au nord, la végétation protégée se fait dense et verdoyante. Saint-Barthélémy abrite 17 espèces protégées dont le Gaïac, un arbre au bois dur, des cactus, des Epidendrum Olivaceum (une orchidée rare), des Acomats (bois pelé)... Les espèces plus courantes sont notamment les mapous blancs, les gommiers rouges et blancs, des poiriers locaux, des Aloès Vera. Les fruitiers locaux sont également très présents comme le Quenettier qui fournit des quenettes (genre de litchis), des raisins de bord de mer, des corossoliers, des pommiers cannelle, des goyaviers, des pommiers cajou... Sur certains versants de Saint-Barthélémy, des traces de cultures anciennes restent encore visibles de nos jours. Ces cultures abandonnées au profit du tourisme sont notamment des ananas, des ignames, des malangas, du coton ou encore des indigotiers... Si ces plantes ont quasiment disparues, il subsiste toujours les petits murets de pierres qui avaient été bâtis par les anciens pour retenir l'eau des mornes.
